Vanaf begin 16e eeuw hadden de 'hoofden' van Ambon en omgeving de teelt van kruidnagels, die op en rond Ternate groeiden, naar hun eilanden overgebracht. Dit werd al gauw een succes, zodat de belangstelling van de Europeanen van de Noord-Molukken naar de Midden-Molukken verschoof. Rond 1600 werden de Portugezen hier door de VOC verjaagd. Daarna werd hier het kruidnagelmonopolie gevestigd. Dat leidde echter nog tot diverse opstanden in de 17e eeuw. Voortaan werden alle kruidnagelbomen die buiten Ambon en de directe omgeving groeiden, uitgeroeid. De bestuurlijke indeling na 1816 veranderde nogal eens, maar Ambon was altijd Residentiehoofdplaats. (P. Boomgaard, 2001)